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第一步，名称核准。外商投资企业申请设立的，申请人可在上海工商局门户网站或自贸试验区综合服务大厅办理名称预先核准。
第二步，负面清单比对。申请人可以访问中国上海门户网站或自贸试验区门户网站的“试验区投资办事直通车”专栏，进入 “负面清单”栏目进行比对，确定所需要填报和提交的备案或审批材料类型。
第三步，互联网“一表申报”。申请人进入“外商投资企业设立”标签页的“网上申请”栏目进行申请信息填写，申请人填写完成后，网站根据申请人填写的信息自动生成各部门所需提交的表格并可下载打印。
第四步，“一口受理”窗口提交材料。申请人携带“一表申报”系统打印的表格及材料至自贸试验区一口受理窗口现场提交，一口受理窗口统一收取材料并在当日转送各职能部门。
第五步，各部门审核(备案）。在收到一口受理材料后，自贸区管委会、工商、质监和税务部门利用政务外网的公网平台进行同步审核或备案。
第六步，统一发证窗口领证。各职能部门审核（备案）完成后，应当将各类证照或结果文书送达一口受理窗口，申请人可在一口受理窗口一次领取。